Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms