Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms