Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIOK2Q9BVS4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIOK2Q9BVS4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms