Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL4Q9BPW4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms