Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms