Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms