Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP53Q96M91 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms