Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms