Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms