Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTP4A1Q93096 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTP4A1Q93096 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms