Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RGP1Q92546 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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