Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C11orf40Q8WZ69 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C11orf40Q8WZ69 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C11orf40Q8WZ69 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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C11orf40Q8WZ69 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C11orf40Q8WZ69 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C11orf40Q8WZ69 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C11orf40Q8WZ69 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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