Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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C9orf40Q8IXQ3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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C9orf40Q8IXQ3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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