Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTF1AQ7RTS3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTF1AQ7RTS3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms