Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP31Q70CQ4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms