Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms