Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms