Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF220Q5VTB9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms