Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDZK1Q5T2W1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms