Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR44Q5JSH3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms