Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms