Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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KHDC3LQ587J8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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KHDC3LQ587J8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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