Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALFQ53S48 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms