Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms