Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms