Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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