Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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