Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms