Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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