Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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