Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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