Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RPE65Q16518 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RPE65Q16518 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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RPE65Q16518 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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RPE65Q16518 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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