Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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