Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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