Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA2Q15560 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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