Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SS18Q15532 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms