Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms