Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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