Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM25Q14258 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms