Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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