Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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