Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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