Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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IFT88Q13099 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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