Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FOXC1Q12948 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXC1Q12948 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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