Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMARCB1Q12824 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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