Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCAPQ12770 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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