Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms