Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PAX8Q06710 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms