Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms