Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CD164Q04900 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms